Los objetivos principales del proyecto son:

• el refuerzo institucional y la integración de las instituciones de Educación Superior a nivel latinoamericano;
• la promoción del Espacio Común de Educación Superior entre UE y América Latina a través de la constitución de, al menos, 25 ALCUE Units, a nivel local, nacional o regional; los ALCUE Units serán las columnas de la "estructura vertebral" de cooperación académica en las dos regiones;
• la promoción y la consolidación de las relaciones entre universidades gobiernos locales-empresas-organizaciones de la sociedad civil, con la finalidad de reforzar la relación universidad-sociedad, contribuyendo a la cohesión social y al desarrollo local-global.